宝宝咳嗽期间是可以吃益生元的。
1、首先解答第一个问题：宝宝咳嗽之所以能吃益生元，是因为益生元属于给肠道有益菌供能的膳食补充成分，不会和止咳、消炎类药物发生冲突，也不会刺激呼吸道加重咳嗽症状。很多宝宝咳嗽期间因为食欲下降、吃药容易打乱肠道状态，补充益生元反而能帮着稳住肠胃环境。
2、接着解答第二个问题：宝宝咳嗽吃益生元不会影响恢复，反而多数情况下还有正向帮助。如果宝宝咳嗽期间服用了抗生素，药物在清除致病菌的同时也会误伤有益菌，补充益生元能帮助有益菌快速恢复繁殖，减少抗生素带来的腹泻、消化不良等副作用，提升宝宝的舒适度，更利于身体恢复。
3、最后要提醒特殊注意事项：如果宝宝咳嗽同时伴随严重的呕吐、急性腹泻，需要先遵从医嘱治疗，暂时不要自行补充益生元；另外要选成分单纯的婴儿专用益生元，不要选添加蔗糖、香精的产品，避免刺激咽喉加重不适。
宝宝咳嗽没有特殊禁忌的话，是可以正常吃益生元的，按需服用不会有问题。