多数情况下，普通细菌性肠炎不建议优先吃阿莫西林，更推荐遵医嘱对症选用头孢克肟。
1、两者的抗菌谱对应致病菌不同，阿莫西林属于广谱青霉素类抗生素，更偏向针对呼吸道、皮肤软组织的革兰阳性菌感染，对多数肠道常见的致肠炎革兰阴性致病菌作用较弱。头孢克肟属于第三代头孢类抗生素，对肠道常见的大肠杆菌、沙门氏菌等革兰阴性致病菌都有良好的抗菌活性，更契合多数细菌性肠炎的抗菌需求。
2、细菌性肠炎选用抗生素首先要明确分型，不是所有肠炎都需要用抗生素。病毒性肠炎、饮食刺激引发的功能性肠炎、炎症性肠病都不需要使用抗生素，只有经医生确诊的细菌性肠炎才需要用抗生素，经验用药优先选择覆盖肠道致病菌的品种。
3、特殊情况可遵医嘱调整用药，如果肠炎合并其他部位敏感菌感染，或是药敏试验明确致病菌只对阿莫西林敏感，可以遵医嘱服用阿莫西林，不要自行更换药物或调整剂量。
肠炎用药前要先明确病因，不要自行盲目服用抗生素，细菌性肠炎需遵医嘱根据自身情况选择药物，避免滥用抗生素引发肠道菌群紊乱。