对于肠胃功能健康的人群来说，空腹吃益生菌是可行的，不存在绝对的坏处；肠胃敏感、患有肠胃基础疾病的人群不建议空腹吃益生菌。
1、健康人群空腹吃益生菌有一定优势：空腹状态下肠胃内没有大量食物阻挡，益生菌可以更快通过胃部抵达肠道完成定植，而且健康人群空腹胃酸浓度不会高到完全灭活益生菌，所以吃了也不会明显影响效果。
2、特殊人群空腹吃益生菌反而有负担：本身肠胃敏感、有胃酸过多、胃溃疡问题的人群，空腹时胃酸浓度较高，不仅会大量灭活益生菌降低效果，还可能刺激受损的肠胃黏膜，引发反酸、胃痛等不适。
3、益生菌什么时候吃效果最好，其实是看人群适配性：除了健康人群可以选择空腹，对大多数人尤其是肠胃偏弱的人来说，饭后15-30分钟吃益生菌效果更稳定。饭后食物稀释了胃酸，能更好保留益生菌活性，也能减少对肠胃的刺激。
服用益生菌不用纠结绝对的标准，只要吃了之后没有不舒服，适合自己的时间就是好时间。