正常遵医嘱或按照说明服用合格的益生元，不会伤害胎儿。
1、吃益生元之所以不会伤害胎儿，是因为益生元本质多是低聚糖类物质，它不会被人体肠道吸收进入血液循环，只会作为养分供给肠道有益菌增殖，因此不会通过胎盘传递影响胎儿，只要是合规产品按正常剂量服用，不存在致畸或伤害胎儿的问题。
2、大部分没有特殊禁忌症的孕妇，都可以在医生指导下放心吃益生元，不少孕期女性受激素影响会出现便秘、肠道菌群紊乱的问题，补充合适的益生元可以帮助调节肠道状态，缓解不适。
3、只有不当服用才可能带来潜在风险：如果自行大剂量服用不合格产品，或是本身对益生元成分过敏，可能引发严重腹泻、过敏反应，严重腹泻可能会间接刺激子宫，这种风险是不当服用导致的，并非益生元本身对胎儿有害。
孕期补充任何膳食补充剂都建议先咨询专业医生，不要自行盲目服用，规范补充不会影响母儿健康。