长期缺少益生菌会破坏肠道微生态平衡，给肠胃、免疫等多方面带来明确的健康危害，放任不管会诱发多种慢性不适。
1、肠胃功能持续紊乱：当体内益生菌数量不足，有害菌会大量繁殖抢占生存空间，破坏肠黏膜屏障，容易引发反复便秘或腹泻、餐后腹胀、长期消化不良等问题，还会降低人体对食物中营养的吸收效率。
2、身体抗病能力下降：人体超过七成的免疫细胞都聚集在肠道，益生菌是维持肠道免疫功能正常运转的重要部分，长期缺少益生菌会导致肠道免疫力下降，人会更容易感冒、过敏，整体抗病能力降低。
3、对于长期缺少益生菌的情况，可从两方面调理：一方面可以通过食补或补充剂直接补充益生菌，日常多吃无糖酸奶、纳豆、韩式泡菜等发酵类食物，也可以选择正规的益生菌补充剂按需补充；另一方面要给体内益生菌补充养分，多吃全谷物、新鲜果蔬等富含膳食纤维的食物，帮助原生益生菌增殖。
日常要注意少滥用抗生素、少吃高油高糖食物，避免进一步破坏体内益生菌的生存环境，已经出现长期不适的要尽早调理菌群状态。
