水苏糖没有耐药性。
1、水苏糖本质是存在于豆类等植物中的天然益生元，人体自身没有能分解水苏糖的酶，因此它不会被人体吸收进入血液循环，也不会像抗生素类药物那样直接作用于病原菌诱导耐药性，它仅作为有益菌的营养来源帮助增殖有益菌，从作用原理上就不存在产生耐药性的可能。
2、长期吃水苏糖也不会产生依赖性。水苏糖并不会代替肠道本身的蠕动、吸收功能，只是给肠道菌群补充所需的营养，帮助维持均衡的肠道环境。停用后只是停止了外源性的营养补充，不会让肠道失去原有功能，也不会出现停药后状态骤降的依赖反应。
3、部分人群刚开始服用水苏糖时，可能会出现腹胀、排气增多的情况，这既不是耐药也不是依赖的表现，是有益菌大量增殖后代谢活跃带来的正常反应，减少服用剂量适应3-5天就能自行缓解。
正常按照自身需求服用水苏糖，不用过度担心耐药、依赖类的问题，可以根据肠道状态灵活调整服用剂量和周期。