益生菌仅对肠道菌群紊乱引发的拉肚子有调理作用，不是所有拉肚子都能靠益生菌改善。
1、益生菌调理拉肚子的核心原理，是补充外源性有益菌，抑制肠道有害菌繁殖，帮助重建平衡的肠道微生态环境。只有菌群失衡这个根源引发的拉肚子，益生菌才能起到缩短病程、缓解不适的作用，非菌群原因引发的拉肚子，益生菌没有明显的调理效果。
2、适合用益生菌调理的拉肚子主要有三类：一是饮食不当、长期作息不规律引发的慢性菌群紊乱性拉肚子；二是服用抗生素后，药物误杀有益菌引发的继发性拉肚子；三是肠易激综合征等功能性肠胃病伴随的反复拉肚子。
3、不适合用益生菌调理的拉肚子也有两类：一类是细菌、病毒感染引发的急性感染性拉肚子，这类拉肚子需要先做抗感染、止泻治疗，盲目吃益生菌可能延误病情；另一类是乳糖不耐受、食物过敏、腹部受凉引发的一过性拉肚子，对症护理就能恢复，不需要额外吃益生菌。
出现拉肚子后要先明确诱因，不要盲目吃益生菌，长期反复拉肚子一定要及时就医检查。